Los Departamentos son los órganos básicos encargados de organizar y desarrollar autónomamente la investigación y, con sujeción a los correspondientes planes de estudio, las enseñanzas propias de su Área o Áreas de Conocimiento respectivas en una o varias Facultades, Escuelas Técnicas Superiores o Escuelas Universitarias.
Cada Departamento tiene un Director nombrado por el Consejo de Departamento, por periodo de dos años, pudiendo ser reelegido.
Los Departamentos que imparten docencia en los distintos cursos de las Titulaciones son:
- BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
- BROMATOLOGÍA Y TECNOLOGÍA DE LOS ALIMENTOS
- CIENCIAS Y RECURSOS AGRÍCOLAS Y FORESTALES
- CIENCIAS SOCIALES Y HUMANIDADES
- DERECHO PÚBLICO Y ECONÓMICO
- ECONOMÍA, SOCIOLOGÍA Y POLÍTICA AGRARIAS
- ESTADÍSTICA, ECONOMETRÍA, INVESTIGACIÓN OPERATIVA Y ORGANIZACIÓN DE EMPRESAS
- FILOLOGÍAS INGLESA Y ALEMANA
- INGENIERÍA ELÉCTRICA
- INGENIERÍA GRÁFICA Y GEOMÁTICA
- MICROBIOLOGÍA
- PRODUCCIÓN ANIMAL
- QUÍMICA AGRÍCOLA Y EDAFOLOGÍA
- QUÍMICA ORGÁNICA